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来源:bob网站    发布时间:2025-12-23 14:05:21

  基于可解释基因程序实现单细胞与空间组学数据的稳健整合与注释的SSpMosaic框架

  随着单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组技术的快速的提升,科学家们能够以前所未有的分辨率解析细胞异质性及其在组织中的空间分布。然而,不同组学模态(如转录组、表观基因组、蛋白质组)的数据在稀疏性、噪声水平和分辨率上存在非常明显差异,导致跨数据集整合困难。传统深度学习模型常被视为“黑箱”,虽预测精度高却缺乏生物学可解释性;而基于基因程序的方法虽能捕捉功能模块,但难以灵活处理多模态数据或整合空间依赖性。这些局限阻碍了人们对复杂组织中细胞状态和相互作用的系统性理解。针对以上问题,南京大学陈迪群团队在《Cell Genomics》上发表了题为“Robust integration and ann

  在病毒的世界里,黄病毒家族是一群臭名昭著的“亲戚”,它们包括寨卡病毒(ZIKV)、登革病毒(DENV)、日本脑炎病毒(JEV)和西尼罗河病毒(WNV)等。这些病毒主要是通过蚊虫叮咬传播,在全世界内造成了巨大的疾病负担。其中,寨卡病毒在2016年曾引发全球公共卫生危机,因其感染孕妇可能会引起胎儿严重的神经系统畸形,至今仍无获批的疫苗。开发黄病毒疫苗面临一个巨大的科学难题:抗体依赖性增强(ADE)。简单来说,当一个人感染过一种黄病毒(如登革病毒)或接种了某种黄病毒疫苗后,体内产生的抗体有时不仅不能保护他,反而会“帮助”另一种黄病毒(如寨卡病毒)更轻松地进入人体细胞,导致更严重的疾病。这种现象在登革病

  论文解读研究背景:联合接种的便利与免疫印记的隐忧随着新冠病毒(SARS-CoV-2)的持续变异,年度加强免疫已成为控制疫情的重要手段。巧合的是,新冠疫苗的接种时间与季节性流感疫苗高度重合。为提升接种效率,同时接种新冠和流感疫苗的策略已在全世界内被广泛推荐。然而,随着数据的积累,科学家们开始关注一个更深层次的问题:这两种疫苗同时进入人体,除了可能会产生“免疫干扰”(即一种疫苗的免疫反应抑制了另一种)外,是否会对免疫系统产生更微妙的影响?其中,最受关注的是“免疫印记”(Immune Imprinting)现象。简单来说,免疫印记是指人体在首次接触某种病原体或疫苗后,免疫系统会形成一种“记忆模板”

  骨髓源性CD169+巨噬细胞通过分泌CCL12招募CCR2+单核细胞加剧自身免疫性肝炎

  在肝脏这个人体最大的实质性器官中,免疫系统的平衡维护至关重要。自身免疫性肝炎(Autoimmune Hepatitis, AIH)作为一种病因不明的炎症性肝病,其特征是免疫介导的肝细胞破坏,导致肝脏进行性坏死性炎症。患者临床表现为急性肝炎,可能进展为肝硬化和终末期肝衰竭。刀豆蛋白A(Concanavalin A, ConA)诱导的急性肝损伤动物模型被大范围的使用在模拟人类临床急性肝炎和免疫介导的肝损伤。研究表明,肝脏中的巨噬细胞在ConA诱导的AIH中扮演重要角色。巨噬细胞是肝脏中最丰富的免疫细胞,参与维持肝脏免疫稳态。然而,肝脏中的巨噬细胞具有非常明显的异质性。库弗细胞(Kupffer cells,

  单细胞测序揭示ZBP1通过CCL7-CCR1轴介导CAF-肿瘤细胞通讯促进口腔鳞癌进展

  口腔鳞癌(OSCC)是头颈部最常见的恶性肿瘤之一,其侵袭性强、易复发转移,导致患者5年生存率长期徘徊在40%-50%的低水平。这种严峻的预后,很大程度上归咎于其复杂的肿瘤微环境(TME)。在TME中,癌症相关成纤维细胞(CAFs)作为最丰富的基质细胞成分,扮演着“帮凶”的角色。它们通过重塑细胞外基质、分泌多种细胞因子和趋化因子,为肿瘤细胞的生长、迁移和免疫逃逸提供了肥沃的“土壤”。因此,深入解析CAFs与肿瘤细胞之间的“对话”机制,对于开发新的OSCC治疗策略至关重要。Z-DNA结合蛋白1(ZBP1)是一种模式识别受体,因其能特异性识别Z构象的核酸而得名。近年来,ZBP1在肿瘤免疫调节中的作用

  在乳腺癌的诸多亚型中,三阴性乳腺癌(TNBC)因其侵袭性强、易转移且缺乏有效靶向治疗方法而成为临床治疗的难点。与激素受体阳性或HER2阳性乳腺癌不同,TNBC患者无法从内分泌治疗或HER2靶向治疗中获益,化疗仍是其主要治疗选择。然而,化疗耐药和肿瘤复发等问题严重制约着TNBC患者的长期生存。近年来研究之后发现,白1(NUPR1)作为一种应激诱导的无序蛋白,在肿瘤进展、治疗抵抗和不良预后中发挥关键作用,成为TNBC治疗的新兴靶点。针对这一临床需求,杭州师范大学医学院马振义团队在《Cell Death & Disease》发表最新研究,开发了一套整合原位邻近连接测序(isPLA-seq)、

  在自然界中,许多蝴蝶通过取食有毒植物,将植物中的次生代谢物转化为自身的防御武器,从而躲避天敌。这种“以毒攻毒”的策略,使得它们成为捕食者眼中难以下咽的“硬骨头”。其中,凤蝶科(Papilionidae)的Troidini族成员,如红珠凤蝶(Pachliopta aristolochiae)和麝凤蝶(Byasa alcinous),便是利用马兜铃酸(Aristolochic acid)进行化学防御的典型代表。它们不仅体内积累着这种对捕食者具有肾毒性和致癌性的苦味物质,还进化出了醒目的警戒色——通常以黑色为底,点缀着鲜艳的红色或黄色斑块,以此向捕食者发出“我有毒,别惹我”的明确信号。然而,这些蝴蝶

  利用携带靶向tRNA衍生小RNA人工miRNA的磁性纳米颗粒增强苹果早期落叶病抗性

  苹果作为全球广泛栽培的经济果树,其生产可持续性正面临早期落叶病的严重威胁。这种由Alternaria alternata f. sp. mali (ALT1)、Glomerella cingulata (GLS1)和Marssonina coronaria (MLS1)等病原真菌引起的病害,导致叶片斑点、早衰脱落,导致非常严重产量损失。传统化学防治不仅带来环境污染和食品安全风险隐患,还诱发病原菌抗药性。因此,开发绿色高效的替代策略迫在眉睫。在这一背景下,中国农业大学果树细胞与分子育种实验室的研究团队在《Plant Communications》发表了创新性研究成果。他们首次揭示了一种病原诱导的tRNA

  伤口愈合是一个复杂而有序的过程,包括止血、炎症、增殖和重塑四个阶段,每个阶段都需要特定的治疗策略。传统伤口敷料通常是静态材料,其性能固定不变,无法适应伤口愈合过程中动态变化的需求。这种静态材料与动态生理过程之间的不匹配,成为先进治疗设计的主要瓶颈。尤其是在感染伤口的管理中,早期需要强效抗菌性能防止细菌定植,而后期则需要抗污性能以避免更换敷料时造成二次损伤。现有材料虽然尝试整合抗菌和抗污功能,但往往需要外部刺激触发转变,且难以精确控制转换时间,限制了其临床实用性。在这项发表于《Cell Biomaterials》的研究中,Wei Zhou、Xiaoyu Jiang、Wenpei Dong等研究人

  在细胞信号转导的复杂网络中,蛋白质酪氨酸磷酸化与去磷酸化的平衡是调控细胞生长、分化和存活的关键。SHP2(SH2 domain-containing protein tyrosine phosphatase 2)作为一种非受体型酪氨酸磷酸酶,在Ras/MAPK等信号通路中扮演着重要角色。然而,SHP2的活性并非时刻开启,它拥有一套精密的“锁钥”机制——在静息状态下,其N端的SH2结构域会像一把锁一样,牢牢地扣在催化结构域的活性中心上,使其处于“自抑制”状态,没办法发挥功能。只有当特定的信号分子,如含有磷酸化酪氨酸(pY)的配体,前来“解锁”时,SHP2才会被激活,从而开启下游的信号级联反应。这种

  辅助放疗对亚洲老年早期IIA期乳腺癌患者的长期生存获益:一项基于人群的研究

  乳腺癌是女性中最常见的癌症,在全世界内发病率一直上升。对于早期乳腺癌,保乳手术(BCS)后根据肿瘤特征进行激素治疗是标准治疗方案。多项随机试验表明,BCS后全乳放疗(RT)能够更好的降低局部复发风险。然而,新兴证据说明,对于年龄≥65岁、患有ER阳性小肿瘤并接受保乳治疗和辅助内分泌治疗的西方女性,可能可以省略放疗。例如PRIME II试验和CALGB 9343试验显示,虽然省略RT会增加局部复发率,但两组患者的10年总生存期(OS)几乎相同。因此,美国国家综合癌症网络(NCCN)指南自2004年起允许在患有ER阳性小肿瘤的老年患者中省略辅助RT。然而,大多数相关研究聚焦于西方人群。先前的研究表明,

  论文解读在量子通信的宏伟蓝图中,量子密钥分发(QKD)作为信息论安全的基石,已从理论走向实践。然而,传统的点对点QKD协议难以满足多用户协同工作的需求,例如多方安全会议或分布式量子计算。为此,量子会议密钥协商(QCKA)应运而生,旨在为多个用户生成共享的安全密钥。尽管理论上已有诸多方案,但实验实现却步履维艰。传统的QCKA协议通常依赖于直接生成和分发多体纠缠态(如GHZ态),这不仅对纠缠源的质量和强度要求极高,还面临着长距离通信信道损耗带来的巨大挑战。此外,测量设备无关(MDI)协议虽然能提升安全性,但其对时间同步和光子不可区分性的苛刻要求,以及随用户数增加而急剧增长的GHZ分析仪复杂度,都限

  在现代社会,随着健康意识的提升,人们越来越关注如何通过饮食来维持和改善健康。然而,对于普通大众而言,要准确判断自己的膳食是否均衡却并非易事。传统的膳食调查方法,如称重记录法、24小时回顾法和食物频率问卷(FFQ),虽然各有优势,但也存在很明显的局限性:称重法虽然准确却费时费力,24小时回顾法依赖记忆且要专业访谈人员,而FFQ则无法精确量化食物摄入量。日本作为一个拥有独特饮食文化的国家,其膳食特点大多数表现在多菜品组合的餐饮模式上。为了指导民众实现均衡膳食,日本政府于2005年推出了“日本膳食指南陀螺(Japanese Food Guide Spinning Top)”,该指南创新性地以“菜品”而

  在孟加拉国西北部西拉杰甘杰地区的贝尔库奇乌帕齐拉,当地居民世代依赖管井获取饮用水和烹饪用水。这些地下水中富含的铁元素,正悄然改变着人们对传统膳食铁来源的认知。作为孟加拉人每日能量来源70%的主食,米饭在蒸煮过程中会吸收大量水分,而这些水分中携带的铁质是否能为人体所利用,成为研究人员关注的焦点。以往研究表明,孟加拉国地下水铁含量存在非常明显地理差异(中位数1.1 mg/L,最高达61 mg/L),全国约76.8%人口依赖管井水。尽管孟加拉传统饮食以谷物为主且富含植酸,不利于二价矿物质的吸收,但2011-12年全国微量营养素调查却显示,该国学龄前儿童、学龄儿童和非孕乳妇(NPNL)的铁缺乏(ID)患病

  在全球能源转型和碳中和目标的推动下,水力发电作为重要的清洁能源,其发展非常关注。然而,气候平均状态随时间的变化如同一把双刃剑,既驱动着清洁能源的需求,也深刻影响着水力发电本身的潜力。中国作为全球最大的能源消费国和水力发电大国,其水电命脉——长江流域,特别是世界最大的三峡水电站(Three Gorges Hydropower Station, TGHS)——的发电稳定性对能源安全和减排承诺至关重要。长期以来,基于气候模型的未来水电潜力(Hydropower Potential, HP)预测存在巨大不确定性,甚至相互矛盾。一些研究预测中国及长江上游流域(Upper Yangtze Basin, UYB)的水电潜力

  追求理想的身体轮廓是现代美容医学中的一个普遍需求,吸脂术作为一种常见的身体塑形手术,旨在移除特定部位难以通过饮食和运动消除的顽固脂肪。传统的吸脂技术虽然有效,但常常要在全身麻醉下进行,伴随一定的创伤和恢复期。近年来,一种名为局部麻醉微创吸脂术(Local Anesthetic Minimally-invasive Liposuction, LAMS)的技术逐渐兴起。它通过在皮下注射大量含有局部(如利多卡因)和血管收缩药(如肾上腺素)的肿胀液(Tumescent Fluid),使脂肪组织肿胀、血管收缩,从而在局部麻醉下,利用连接注射器或低负压吸引器的细钝头导管,以较低压力抽吸脂肪。这种方

  马来西亚婆罗洲砂拉越州加帛医院疟疾患者中诺氏疟原虫配子体携带率与载量分析

  在东南亚的森林边缘,一种原本在猕猴间传播的疟疾——诺氏疟原虫(Plasmodium knowlesi)感染,正悄然成为人类健康的重大威胁。自2018年起,P. knowlesi已成为马来西亚本土疟疾的唯一病原体,病例数持续攀升。这种“共患”的疾病,其传播途径究竟是单纯的“猴传人”,还是已经具备了“人传人”的能力,是当前防控工作的核心谜题。要回答这样的一个问题,重点是配子体(gametocyte)。配子体是疟原虫生命周期中唯一能够感染蚊子的阶段,只有血液中携带活配子体的感染者,才可能通过蚊媒叮咬将疾病传给下一个人。然而,P. knowlesi的配子体在显微镜下形态与无性期滋养体极为相似,难以准确

  布联合肺表面活性物质对≤28周极早产儿疗效的系统评价与Meta分析

  当婴儿过早地来到这样一个世界,他们的肺部往往还没做好独立呼吸的准备。对于妊娠28周及以下的极早产儿来说,这种不成熟带来的挑战尤为严峻。他们的肺部缺乏足够的肺表面活性物质(PS)——一种能够降低肺泡表面张力、防止肺泡塌陷的关键物质,因此极易发生呼吸窘迫综合征(RDS)。更令人担忧的是,长期的机械通气和氧气支持虽然能维持生命,却可能引发炎症反应,最后导致一种慢性肺部疾病——支气管肺发育不良(BPD)。BPD不仅延长住院时间,还可能带来长期的神经发育和呼吸系统问题,成为极早产儿生存质量的主要威胁。为了预防BPD,临床医生尝试了很多方法。全身性虽然有效,但早期使用(出生后7天内)可能增加脑瘫风